La Orquesta Barroca de la Unión Europea es muy especial: cada año se selecciona una orquesta completamente nueva, entre los jóvenes con más talento de toda Europa, que están empezando su carrera como profesionales de la música barroca. Veinticinco músicos son seleccionados por medio de audiciones y pasan a formar parte de la orquesta por un período de seis meses. En julio comienza una etapa de estudios y ensayos de preparación a una larga gira de conciertos en colaboración con los mejores directores del mundo. Durante este corto período de tiempo, la orquesta alcanza cada año un alto nivel que iguala al de las orquestas profesionales, a las que los músicos aspiran a pertenecer. Al final de estos seis meses, la orquesta se disuelve y el proceso comienza de nuevo.

La escasez de estudiantes de música barroca, así como de profesores y directores, hace imposible a los conservatorios (quizá con alguna rara excepción) formar una orquesta, es por ello que las posibilidades de formación que ofrece la EUBO constituyen una oportunidad excelente para jóvenes músicos (cualquiera que sea su sexo, nacionalidad o idioma o procedencia dentro de la Unión Europea) para facilitar el paso entre los estudios del conservatorio y la carrera profesional. La EUBO proporciona este paso a un gran número de músicos en este momento crítico de su carrera. Así, la orquesta cuenta con miembros de casi todas las nacionalidades de la UE, la edad media de los músicos siendo de 24 años. Los instrumentos que utilizan son, en su mayoría, reproducciones muy precisas de instrumentos del siglo XVIII, ya que instrumentos originales en buena condición son, no sólo escasos sino también muy costosos.

El éxito de la EUBO se hace patente mirando el número, cada vez mayor, de antiguos estudiantes de la misma que en la actualidad son miembros de las principales orquestas profesionales europeas como Les Arts Florissants, The English Concert, Musica Antiqua Köln, The King's Consort, Concerto Copenhagen, Les Musiciens du Louvre, Academy of Ancient Music, Il Giardino Armonico y Amsterdam Baroque Orchestra.

Lars Ulrik Mortensen es el director musical de la Orquesta desde 2004. En el año 2012, la orquesta trabajará bajo su dirección musical y con los directores invitados: Margaret Faultless, Riccardo Minasi y Paul Agnew. Cada año, la EUBO realiza conciertos y radioemisiones en toda Europa. Desde el año 2008, los ensayos y los periodos de formación tienen lugar en la ciudad de Echternach en Luxembourg. La EUBO tambien esta invitada para residencias por Les Jardins d'Agrement, Amilly, France, Stiftung Kloster Michaelstein, Blankenburg, Alemania, Collegio Ghislieri, Pavia, Italia y, por primera vez en 2012, por De Bijloke, Gante, Bélgica.

La Orquesta Barroca de la Unión Europea fue creada como una de las iniciativas más importantes de "El Año Europeo de la Música" en 1985, y ha trabajado año tras año con la ayuda económica de la Comisión Europea.